Verschil tussen VNTR en STR | VNTR vs STR

Belangrijkste verschillen - VNTR vs STR

DNA-studies hebben immens nut in het begrijpen en bepalen van fylogenetische relaties, het diagnosticeren van genetische ziekten en de genoom van organismen. Verschillende technieken geassocieerd met DNA analyse worden gebruikt voor de identificatie van een bepaald gen of een DNA sequentie in een pool van onbekend DNA. Ze staan bekend als genetische markers. Genetische markers worden gebruikt in moleculaire biologie om genetische variatie tussen individuen en soorten te identificeren. Variabele nummer tandemherhaling (VNTR) en korte tandemherhaling (STR) zijn twee soorten genetische markers die polymorfisme onder individuen tonen. Beide typen zijn niet-coderende herhalende DNA, die tandemherhalingen zijn. Ze zijn in een hoofd tot staart mode in chromosomen geregeld. VNTR is een gedeelte van het genoom waar korte nucleotide sequentie meerdere malen wordt herhaald. STR is een andere sectie van DNA binnen het genoom dat is georganiseerd als herhalende eenheden bestaande uit twee tot dertien nucleotiden in honderd keer. Het belangrijkste verschil tussen VNTR en STR is het aantal nucleotiden in een herhaalde volgorde. Herhaling van eenheden van VNTR bestaat uit 10 tot 100 nucleotiden, terwijl de repeater van STR bestaat uit 2 tot 13 nucleotiden . VNTR en STR worden veel gebruikt in forensische studies.

INHOUD

1. Overzicht en sleutelverschil

2. Wat is VNTR

3. Wat is STR

4. Vergelijkingen tussen VNTR en STR

5. Vergelijking naast elkaar - VNTR vs STR in tabelvorm

6. Samenvatting

Wat is VNTR?

Een tandem herhaling is een korte sequentie van DNA dat in hoofd tot staart mode wordt herhaald op een specifieke chromosomale locus. Er is geen andere sequentie of nucleotide binnen de tandem herhaling. Er zijn verschillende soorten tandemherhalingen in het genoom. VNTR is een soort tandemherhaling onder hen die herhalende eenheden heeft die 10 tot 100 nucleotiden bevatten. VNTR is een soort minisatelliet. Deze tandem herhalingen zijn te vinden in veel chromosomen. Ze worden gesplitst binnen het menselijk genoom en liggen overwegend in de subtelomere gebieden van chromosomen.

VNTRs tonen tandem herhaling polymorfisme onder individuen. De lengte van de VNTR in een bepaalde locatie van het chromosoom is zeer variabel onder individuen door de variatie in het aantal herhalende eenheden georganiseerd in dat DNA-gedeelte. Daarom kan VNTR worden gebruikt als een krachtig instrument bij de identificatie van individuen en VNTR analyse wordt gebruikt in vele gebieden, waaronder genetica, biologie onderzoek, forensics en DNA vingerafdrukken.VNTR's waren de eerste genetische merkers die gebruikt werden om de beenmergtransplantatie te vermenigvuldigen. VNTR's waren ook de eerste polymorfe markers die in DNA-profilering in forensics werden gebruikt.

Figuur 01: Variatie van VNTR's bij zes individuen

VNTR analyse wordt uitgevoerd via restrictie fragment lengte polymorfisme gevolgd door zuidelijke hybridisatie. Daarom heeft het relatief een groot DNA-monster nodig. VNTR profiel interpretatie is ook problematisch. Vanwege deze beperkingen is het gebruik van VNTR in forensische genetica beperkt en wordt het vervangen door STR analyse.

Wat is STR?

STR is een zeer repetitieve DNA sectie die bestaat uit twee tot dertien nucleotide repeating units georganiseerd op tandem wijze. STR is vergelijkbaar met VNTR. Maar het varieert van VNTR van het aantal nucleotiden in een herhaalde volgorde en het aantal herhalingen. STR is een soort microsatelliet.

STR analyse betrokken bij het meten van het exacte aantal herhalende eenheden. STR's zijn zeer variabel onder individuen, vergelijkbaar met VNT's. STR profielen verschillen van persoon tot persoon. Daarom wordt STR analyse gebruikt in moleculaire biologie om specifieke loci op DNA van twee of meer monsters te vergelijken. Vandaar dat STR's worden beschouwd als krachtige genetische markers in moleculaire biologie. Het is een uitstekend instrument voor identificatie van individuen door hun hoge mate van polymorfisme en relatief korte lengte.

Momenteel zijn STR's het meest gebruikte geanalyseerde genetische polymorfisme instrument in forensische genetica. De meeste forensische casework behelst STR polymorfe analyse. STR loci zijn verspreid over het genoom. Er zijn duizenden STR's in chromosomen die in forensische analyse kunnen worden gebruikt. STR analyse omvat geen restrictie lengte polymorfisme zoals VNTR analyse. STR analyse snijdt geen DNA met restrictie enzymen. Specifieke probes worden gebruikt om de gewenste gebieden aan DNA te bevestigen en PCR techniek te gebruiken, de lengten van de STR worden bepaald.

Figuur 02: STR variatie tussen monsters

Wat zijn de overeenkomsten tussen VNTR en STR?

VNTR en STR zijn niet-coderend DNA.
Beiden zijn tandem herhalingen.
Beide tonen polymorfisme onder individuen door het verschil in de lengte van het DNA-gedeelte.
Beiden worden gebruikt als krachtige genetische markers in DNA-vingerafdrukken en in forensische studies.

Wat is het verschil tussen VNTR en STR?

- diff Artikel Midden voor Tabel ->

VNTR vs STR
VNTR is een niet-coderend herhalend DNA dat een korte nucleotidesequentie heeft die op tandem wordt herhaald.	STR is een zeer repetitieve DNA sectie die bestaat uit twee tot dertien nucleotide repeating units georganiseerd op tandem wijze.
Grootte
VNTR's zijn groter dan STRs.	STR's zijn kleiner dan VNTR's.
Aantal nucleotiden in herhalende sequentie
De herhalende eenheid van VNTR bestaat uit 10 tot 100 nucleotiden.	De herhalende eenheid van STR bestaat uit 2 tot 13 nucleotiden.

Samenvatting - VNTR vs STR

VNTR en STR zijn twee krachtige genetische markers gebruikt in moleculaire biologie, met name op het gebied van forensische genetica.VNTR is een soort minisatelliet en STR is een microsatelliet. VNTR en STR zijn niet-coderend, hoogst repetitief DNA. Ze zijn tandem herhalingen. De algemene structuur van VNTR en STR zijn hetzelfde. Het aantal nucleotiden in de herhalende sequentie en de lengte zijn echter verschillend. VNTR heeft herhalende sequenties bestaan uit 10 tot 100 nucleotiden. STR heeft herhalende sequenties bestaande uit 2 tot 13 nucleotiden. Dit is het verschil tussen VNTR en STR.

Download PDF Versie VNTR vs STR

U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en gebruiken voor offline doeleinden zoals per aanhalingstekens. Download hier PDF-versie Verschil tussen VNTR en STR.

Referenties:

1. "De wetenschap van gerechtelijke genetica. "CRG - Raad voor Verantwoordelijke Genetica. N. p., n. d. Web. Beschikbaar Hier. 10 juli 2017.

2. "STR analyse. "Wikipedia. Wikimedia Foundation, 22 maart 2017. Web. Beschikbaar Hier. 10 juli 2017.

Image Courtesy:

1. "D1S80Demo" Door PaleWhaleGail in Engels Wikipedia (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia