Verschil tussen transposon en retrotransposon
Transposon vs Retrotransposon
Transposons en retrotransposons zijn genetische componenten van DNA, en er zijn grote verschillen tussen hen. Het percentage aanwezigheid van deze genetische materialen varieert over soorten, en hun functies bepalen de lotgevallen van het organisme met mutaties en andere fenotypisch belangrijke veranderingen. Transposons en retrotransposons zijn genen of verzamelingen van bepaalde genen in de DNA-strengen, en veranderingen van hun locaties zijn de belangrijkste oorzaken voor deze gevolgen. Dit artikel beoogt echter kortom de functies van deze genen te bespreken en presenteert een vergelijking tussen transposons en retrotransposons.
Wat is Transposon?
Transposons zijn interessante fragmenten of segmenten van DNA met de mogelijkheid om de locatie van de DNA-streng te veranderen in de vorm van snij- en plakmechanisme. Vanwege deze mobiele aard van de transposons staan deze bekend als springgenen. Transposons zijn van twee belangrijke typen bekend als Klasse I Transposons en Klasse II Transposons. Meestal wordt het type II-type aangeduid als de transposons en het type I-type wordt verwezen als de retrotransposons. De processen van het snijden en plakken van mobiele DNA-segmenten worden gereguleerd door het enzymtransposase. Het enzym bindt aan de beide uiteinden van de transposon en snijdt de fosfodiesterbindingen van de DNA-streng, isoleer de transposon, verplaats deze naar de doelplaats en bind de nieuwe locatie. Dit proces is echter interessant om te begrijpen, omdat sommige transposons alleen kunnen verplaatsen naar bepaalde locaties door de incompatibiliteit van basissequenties met de doelplaats. Genen met één uiteinde van een enkele streng hebben dezelfde basissequentie met het andere uiteinde van de andere enkele streng zijn transposons met kleverige randen, omdat deze kunnen binden aan de sites van de target DNA-streng met dezelfde basissequentie als in de kleverige uiteinden. Deze mobiliteit van genen kan echter veranderingen van het genotype evenals in het fenotype van het organisme veroorzaken. Wetenschappers uitgevonden over de transposons en genetisch gemodificeerde levensmiddelen en organismen volgens de voorkeursaanpassingen werden vervolgens ter beschikking gesteld. Zeer productieve landbouwgewassen, antibiotica met geneeskrachtige eigenschappen, vee dieren waren enkele van de voordelig ontwikkelde producten na de uitvinding van transposons door Barbara McClintock in 1940's.
Wat is Retrotransposon?
Retrotransposons zijn de transposons van klasse I, en deze gaan door het genoom door het mechanisme van kopiëren en plakken. Het mechanisme van de mobiliteit van retrotransposons omvat weinig belangrijke stappen zoals het kopiëren van het gensegment van de DNA-streng in RNA, overdracht van de kopie van RNA naar de doelplaats, transcriptie van de RNA-sequentie terug naar DNA met behulp van omgekeerd transcriptase en invoeging van het gen naar de nieuwe locatie van DNA-streng van genoom.De twee uiteinden van deze retrotransposons hebben meestal lange terminale herhalingen met ongeveer 1000 basisparen, en die worden gebruikt als identificatiekenmerken van deze genen. Deze genen worden gemakkelijk geamplificeerd binnen het genoom, en het percentage retrotransposons in het menselijk genoom is ongeveer 50%. Dit kan heel gevaarlijk zijn omdat het oorzakelijk virus van aids-, HIV- en T-cel leukemie-virus de retrotransposons in hun RNA-genen heeft. In feite kunnen deze virussen de retrotransposons binden op elke plaats van de menselijke DNA-strengen met behulp van omgekeerde transcriptase en integrase. Het integrase-enzym werkt op dezelfde manier als transposase in klasse II transposons.|
Wat is het verschil tussen Transposon en Retrotransposon? • Transposons zijn klasse II springende genen, terwijl retrotransposons vallen in de categorie van klasse I. • Transposons functie met het transposase enzym, terwijl retrotransposons functioneren met behulp van twee hoofd enzymen bekend als reverse transcriptase en integrase. • De terminaleinden zijn veel langer in retrotransposons dan in transposons. • Transposons worden gesneden van de oorsprong en op het doel geplakt; omgekeerd worden retrotransposons van de oorsprong naar RNA gekopieerd en op het doel getranscribeerd. |
