Verschil tussen Benzonase en DNase | Benzonase vs DNase

Sleutel Verschil - Benzonase vs DNase

Degradatie van nucleïnezuren is belangrijk voor veel moleculaire biologie technieken. Het wordt wijd gebruikt in recombinante DNA-technologie om zich te ontdoen van ongewenste fragmenten van DNA en RNA. Nucleïnezuurverminderende enzymen worden Nucleases genoemd, en ze kunnen van verschillende typen zijn op basis van de vereiste functie. Nucleases die DNA afbreken, staan bekend als DNases terwijl degenen die RNA degraderen, bekende RNasen zijn. Deze enzymen worden meestal gebruikt in in vitro experimenten waarbij in vitro moleculaire tests worden uitgevoerd om zuiver DNA, RNA of eiwitten te isoleren. Benzonases zijn een type nucleasen die zowel DNA als RNA degraderen terwijl DNases alleen DNA afbinden. Dit is het belangrijkste verschil tussen Benzonase en DNase.

INHOUD

1. Overzicht en sleutelverschil

2. Wat is Benzonase

3. Wat is DNase

4. Vergelijkingen tussen Benzonase en DNase

5. Vergelijking naast elkaar - Benzonase vs DNase in tabelvorm

6. Samenvatting

Wat is Benzonase?

Benzonase is een genetisch gemanipuleerd endonuclease van Serratia marcescens. Dit enzym wordt geproduceerd in E. coli gastheren in industriële schaal. Benzonase is in staat om dubbelstrengs DNA, lineair DNA, cirkelvormig DNA en enkelstrengs RNA te splitsen. Zo is Benzonase commercieel belangrijk. Benzonase enzym is een eiwit dimer met 245 identieke aminozuren, ~ 30 kDa subeenheden met twee essentiële disulfide bindingen. Benzonase splitst nucleïnezuren bij het 5'-uiteinde en resulteert in fragmenten met vrije 5'ende. Benzonase kan nucleïnezuren in elke volgorde splitsen, maar prefereren GC-rijke gebieden.

Benzonase wordt opgeslagen bij -20 ⁰ C. De optimale pH voor enzymactiviteit blijkt te zijn 8. 0-9. 2. De toepassingen van Benzonase omvatten monsterbereiding voor eiwit 2D gelelektroforese waarbij Benzonase gebonden nucleïnezuren verwijdert en verwijdering van nucleïnezuurverontreinigingen uit recombinante eiwitpreparaten. Het wordt ook gebruikt om de viscositeit van eiwitextracten te verminderen en om cellen in een celmengsel te blokkeren.

Wat is DNase?

DNase is een nuclease, hydrolytisch enzym dat alleen in staat is om dubbelstrengs DNA te splitsen. Er zijn twee hoofdvormen DNases: DNase I en DNase II. DNase Ik participeer in het splitsen van dubbelstrengs DNA om polynucleotiden te produceren met 5 'vrije einden. DNase II is betrokken bij het splitsen van dubbelstrengs DNA om polynucleotide strengen te produceren met 3 'vrije einden of overhangen.

DNase I

DNase I functioneert bij een optimale pH tussen 7. 0 - 8. 0. De enzymactiviteit is afhankelijk van veel ionische cofactoren, waaronder Ca ²⁺ , Mg ^{2 +} of Mn ²⁺ . De activiteit van Mg ²⁺ en Mn ²⁺ bepaalt de functie van de DNase I. In aanwezigheid van Mg ²⁺ , splitst DNase I elke streng van dsDNA onafhankelijk. Dit vindt op willekeurige wijze plaats. In contrast, in aanwezigheid van Mn ^2+, , slaat het enzym beide DNA-strengen op ongeveer dezelfde plaats. Deze splitsing zal resulteren in het produceren van twee soorten DNA fragmenten; een type met stompe einden en een ander type met een of twee nucleotide overhangen.

Figuur 02: DNase

DNase II

DNase II functioneert bij een optimale pH van 4. 5-5. 0 en tweewaardige metaalionen zijn nodig voor zijn activiteit, vergelijkbaar met DNase I. Het mechanisme van DNase II is bekend uit drie hoofdstappen te bestaan.

Meerdere enkelvoudige breekpunten worden geïnduceerd binnen de DNA-ruggengraat.
Zure oplosbare nucleotiden en oligonucleotiden worden geproduceerd.
Niet-lineaire hyperchromische verschuiving vindt plaats in de laatste fase.

De belangrijkste remmers van enzym DNase omvatten metaalchelators, overgangsmetalen en chemicaliën zoals natriumdodecylsulfaat en β-mercaptoethanol.

De belangrijkste toepassingen van DNase omvatten de bereiding van DNA-vrije RNA-extracten en eiwit-extracten en verwijdering van template DNA tijdens in vitro transcriptie experimenten.

Wat zijn de overeenkomsten tussen Benzonase en DNase?

Beiden zijn hydrolytische enzymen.
Beide zijn nucleasen.
Beide participeren door de fosfodiesterbindingen van nucleïnezuren te splitsen.
Beiden hebben een optimale pH en opslagtemperatuur nodig om de activiteit van het enzym te handhaven.
Remmers van enzymen omvatten chelaatmiddelen, overgangsmetalen en detergentchemicaliën.
Toepassingen zijn vooral gericht op het verkrijgen van hoge zuiverheidsextracten van DNA, RNA en eiwitten.
Beide enzymen kunnen worden geproduceerd via genetische engineering.

Wat is het verschil tussen Benzonase en DNase?

- diff Artikel Midden voor Tabel ->

Benzonase vs DNase
Benzonase is een enzym dat in staat is om dubbelstrengs DNA, lineair DNA, cirkelvormig DNA en RNA te splitsen.	DNase is een enzym dat in staat is om dubbelstrengs DNA te splitsen.
Substraat voor het enzym
Beide DNA en RNA zijn substraten voor benzonase.	DNA is het substraat voor DNase.
Structuur
Het optimale pH bereik van Benzonase is 7-0-8. 0	Optimale pH-waarden van DNase I is 7. 0 - 8. 0 en DNase II is 4. 5 - 5. 0.

Samenvatting - Benzonase versus DNase

Nuclease enzymen worden veel gebruikt in verschillende experimentele procedures met betrekking tot moleculaire biologie en genetische engineering. Benzonase en DNase zijn twee soorten nucleasen. Benzonase is betrokken bij het afbreken van zowel DNA als RNA, terwijl DNase betrokken is bij het splitsen van dubbelstrengs DNA. Dit is het fundamentele verschil tussen benzonase en DNase. Op dit moment worden beide nuclease types geproduceerd door middel van recombinant DNA technologie, die een hogere kwaliteit enzymen levert die geoptimaliseerd zijn voor maximale productie.

Download PDF Versie Benzonase vs DNase

U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en gebruiken voor offline doeleinden zoals per citaatbrief. Download hier PDF-versie Verschil tussen Benzonase en DNase

Referenties:

1. "Deoxyribonuclease I van boviene pancreas D5025. "Sigma-Aldrich, beschikbaar hier. Toegankelijk 19 september 2017.

2. "Deoxyribonuclease II. "Deoxyribonuclease II - Worthington Enzyme Handleiding, beschikbaar hier. Toegankelijk 19 september 2017.

Image Courtesy:

1. "DNA-hypersensitieve plaats" door Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. - Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. (2012) Correlatie tussen DNase I Overgevoelige Site Distribution en Gene Expression in HeLa S3 Cells. PLoS ONE 7 (8): e42414. doi: 10. 1371 / journal. pone. 0042414 (CC BY-SA 2. 5) via Commons Wikimedia