Verschil tussen Rooted en Unrooted Phylogenetic Tree | Rooted vs Unrooted Phylogenetic Tree

Hoofdverschil - Gegoten tegen Unrooted Phylogenetic Tree

Phylogenie is een belangrijk veld dat het leven op aarde door de tijd verkent. Het onthult de verbinding tussen organismen met hun voorouders en afstammelingen. De relaties tussen organismen worden schematisch voorgesteld door verschillende boomachtige voorstellingen zoals dendogram, cladogram, fenogram, phylogram, enz. Een fylogenetische boom is een vertakkend boomachtig diagram dat de fylogenetische relaties tussen organismen met de hoeveelheid evolutionaire afstand verklaart. Er zijn twee hoofdsoorten van fylogenetische bomen die bekend staan als geworteld en ongebroken. Het belangrijkste verschil tussen de gewortelde en ongebroken fylogenetische boom is dat rooted tree de meest basale voorouder van de boom toont terwijl unrooted fylogenetische boom geen voorouderlijke wortel laat zien.

INHOUD

1. Overzicht en sleutelverschil

2. Wat is een Rooted Phylogenetic Tree

3. Wat is een Unrooted Phylogenetic Tree

4. Zij aan elkaar vergelijken - Gegoten tegen ongegoten Phylogenetic Tree

5. Samenvatting

Wat is een Rooted Phylogenetic Tree?

Een gewortelde fylogenetische boom dient als een bruikbaar diagram dat de evolutionaire geschiedenis laat zien. Het heeft een basaal knooppunt dat de wortel wordt genoemd, die de gemeenschappelijke voorvader van alle groepen van de boom vertegenwoordigt. De wortel van een boom wordt beschouwd als het oudste punt in de boom, die de laatste gemeenschappelijke voorouder vertegenwoordigt van alle groepen die in de boom zijn opgenomen. Daarom laat een gewortelde boom de richting van de evolutionaire tijd zien. Van een enkele soort van een gewortelde boom, kan de gemeenschappelijke voorvader of de soort voorvader worden gevonden door terug te traceren naar het basale knooppunt. Aangezien de gewortelde boom de richting van de evolutionaire tijd weergeeft, is het gemakkelijk om de oudere of nieuwere groepen te vinden. Een gewortelde boom kan gebruikt worden om de hele groep organismen te bestuderen. Nauwkeurige worteling van een fylogenetische boom is een belangrijke en cruciale factor, omdat onjuiste worteling kan leiden tot verkeerde interpretaties van genetische veranderingen tussen organismen en hun directionality van de evolutie.

Figuur 01: Een Gegoten Phylogenetische Boom

Wat is een Unrooted Phylogenetic Tree?

Een ongebroken filogenetische boom is een fylogenetisch diagram dat geen gemeenschappelijke voorvader of een basaal knooppunt heeft. Dit soort boom geeft geen aanleiding tot de oorsprong van de evolutie van de belangengroepen.Het laat alleen de relatie tussen organismen zien, ongeacht de richting van de evolutionaire tijdlijn. Daarom is het moeilijk om de evolutionaire relaties van de groepen te bestuderen met betrekking tot de tijd door een ongeroteerde boom te gebruiken.

Er zijn twee belangrijke manieren om een ongebroken filogenetische boom te wortelen. Zij zijn

Een groep zoeken - Dit vereist voorkennis over de relaties tussen taxa. Dan kan een taxon die buiten de groep ligt, gebruikt worden als een groep om een gewortelde fylogenetische boom te trekken.
Het middenpunt of de afstand vinden - Het middelpunt van de verste twee taxa in de boom kan worden aangenomen als een wortel voor de fylogenetische boom.

Figuur 02: Een ongestoorde filogenetische boom

Wat is het verschil tussen Rooted en Unrooted Phylogenetic Tree?

- diff Artikel Midden vóór Tabel ->

Gegoten tegen Unrooted Phylogenetic Tree
Een gewortelde fylogenetische boom is een diagram dat de laatste gemeenschappelijke voorouder van de groepen laat zien.	Een ongebroken filogenetische boom toont de relaties tussen organismen zonder de gemeenschappelijke voorouder te laten zien.
Knooppunt
Het heeft een knooppunt (root).	Het heeft geen knooppunt.
Richting van Evolutie
Het heeft een richting om de evolutietijd aan te geven.	Het geeft geen evolutie relatie aan.
Houding ten opzichte van anderen
Met de boom kan de voorouder-afstammende relatie tussen groepen worden bepaald.	De boom staat niet toe om te praten over voorouder - afstamming relatie.

Samenvatting - Rooted vs Unrooted Phylogenetic Tree

Een fylogenetische boom vertegenwoordigt de evolutionaire wegen en verbindingen tussen organismen met behulp van een vertakte boomachtige diagrammen. Phylogenetische tress kan worden geworteld of ongestoord. Een gewortelde boom heeft een knooppunt aan de basis, die de gemeenschappelijke voorvader vertegenwoordigt die alle belangengroepen verbindt. Een ongeroteerde boom toont de relaties tussen organismen. Het geeft echter niet de gemeenschappelijke voorvader die alle groepen delen. Dit is het verschil tussen gewortelde en ongebroken filogenetische boom.

Referenties:

1. "Boom" Feiten: Gegoten tegen Ongezaagde Bomen. "Nationaal Centrum voor Biotechnologie Informatie. U. S. National Library of Medicine, n. d. Web. 04 april 2017

2. Graham, Sean W., Richard G. Olmstead en Spencer C. H. Barrett. 'Rooting Phylogenetic Trees with Distant Outgroups: Een casestudy van de Commelinoid Monocots. "Moleculaire biologie en evolutie. Oxford University Press, 01 oktober 2002. Web. 04 april 2017