Prokaryotisch vs eukaryotisch genoom
Prokaryotisch versus Eukaryotisch Genoom
Het totale genetische gehalte van een organisme is bekend als 'genoom'. Het omvat zowel genen als niet-coderende sequenties van DNA of RNA. Voor zowel prokaryoten als eukaryoten is het genetische materiaal in het genoom het DNA. De sequentie, structuur en chemische modificatie van het DNA duidt op de informatie die in het genoom wordt gehouden. Niet alleen dat, het maakt het ook mogelijk om het genoom te repliceren, te repareren en te onderhouden. Opslag en replicatie van beide genen zijn verschillend, maar de structuur van het DNA blijft hetzelfde (Double Helix).
Prokaryotische Genoom
Gewoonlijk hebben prokaryote organismen relatief kleine genen die bestaan uit één of meer DNA-moleculen. In sommige prokaryoten kunnen de cellen één of meer exemplaren van bijbehorende DNA-moleculen, bekend als 'plasmiden', bevatten. Het genoom en de plasmiden zijn vaak circulaire in prokaryoten, maar er kunnen ook uitzonderingen zijn. Meestal bevatten plasmiden enkele niet-essentiële informatie in hun cellen. Het genoom en plasmiden worden gevonden in het cytoplasma van de prokaryote cellen.
Eukaryotisch Genoom
Eukaryotisch genoom bevat grotere en lineaire DNA-moleculen verpakt met histonproteïnen in chromosomen. Deze chromosomen worden verzameld in een kern die omringd is met een nucleaire envelop. Daarnaast kunnen circulaire DNA-moleculen worden gevonden in de mitochondria en chloroplast. Deze DNA-moleculen worden ook beschouwd als een onderdeel van het prokaryotische genoom.
Prokaryotische vs Eukaryotische Genoom
• Prokaryotisch genoom bevat slechts één chromosoom, maar eukaryotisch genoom bevat meerdere chromosomen. Door dit verschil is een groot deel van het eukaryotische genoom aanwezig in een kern die de grootste organel in een levende cel is. Er is geen dergelijke organel gevonden in prokaryoten, zodat hun genoom in het cytoplasma kan worden gevonden.
• Over het algemeen heeft prokaryotisch DNA een cirkelvormige structuur, maar er zijn uitzonderingen. DNA-lineaire strengen zijn aanwezig in de eukaryote cellen.
• In tegenstelling tot het prokaryotische genoom is het eukaryotische genoom complexer met langere genen.
• Prokaryotisch genoom heeft tot 90% coderende sequenties, terwijl de coderende sequentie in eukaryotisch genoom vaak ongeveer 3% is.
• 'Supercoiling van DNA' tijdens de celcyclus bestaat in zowel prokaryotische als eukaryote genen, maar nog steeds zijn de supercoilingpatronen verschillend. Aangezien de prokaryoten cirkelvormige genen hebben, hebben de domeinen de neiging om van de lus afgeknipt te worden om kleine supercoiled domeinen te vormen.
• Er is een replicatieplaats nodig voor circulaire prokaryotische genoom. Het beginpunt van replicatie staat bekend als 'ori'.Replicatie begint vanaf dit punt en verloopt in beide richtingen, wat resulteert in zeer snelle divisiesnelheden in prokaryoten, meer dan in eukaryoten.
• Niet-coderende DNA-uiteinden, ook wel telomeren genoemd, zijn aanwezig in eukaryotisch genoom. Telomeren kunnen niet worden gekopieerd tijdens het replicatieproces. Het prokaryotische genoom, dat cirkelvormig is, heeft geen dergelijk einde of telomere, zodat het gehele genoom kan worden gekopieerd.
• Eukaryotisch genoom kan haploïd of diploïd zijn, terwijl prokaryotisch genoom niet haploïd kan zijn, aangezien prokaryoten slechts één chromosoom in hun genoom hebben.
• Introns zijn DNA-fragmenten tussen secties van een echt gen. Deze introns zijn meer voorkomend in eukaryotisch genoom, terwijl ze zeer zeldzaam zijn in het prokaryotische genoom.
• Eukaryoten kunnen lange strekken hebben van twee of meer herhalende nucleotiden. Daarom, in tegenstelling tot in eukaryotisch genoom, zijn herhaalde sequenties zeer zeldzaam in het prokaryotische genoom.
• In tegenstelling tot in het eukaryotische genoom zijn er veel eiwitten die coderen voor genen beschikbaar in het prokaryotische genoom.
• Eukaryotisch genoom heeft normaal gesproken honderden rRNA genen, terwijl prokaryotisch genoom 1 tot 10 rRNA genen (gemiddelde <5) heeft.