Verschil tussen genotyping en sequencing | Genotyping vs Sequencing

Belangrijkste verschil - Genotyping versus sequentiebepaling

Genotypering en sequencing zijn twee technieken die worden uitgevoerd om informatie over de nucleïnezuren, voornamelijk DNA van een organisme, te verkrijgen. Het belangrijkste verschil tussen genotypering en sequencing is dat genotypering het proces is om te bepalen welke genetische variant het individu bezit met behulp van markers, terwijl sequencing de bepaling van de juiste volgorde van de nucleotidesequentie binnen het gegeven fragment van DNA is.

INHOUD

1. Overzicht en sleutelverschil

2. Wat is Genotyping

3. Wat is Sequencing

4. Zij aan elkaar vergelijken - Genotyping vs Sequencing

5. Samenvatting

Wat is Genotyping?

Genotypering is de bepaling van de genetische samenstelling van een individu met behulp van een sequentie van DNA en markers en vergelijking en identificatie van zijn erfdeel. Genotyping is belangrijk in evolutionaire biologie, populatiebiologie, taxonomie, ecologie en genetica van de organismen. Het kan uitgevoerd worden door verschillende technieken, waaronder DNA sequencing, polymerase kettingreactie, restrictie fragment lengte polymorfisme (RFLP), willekeurig geamplificeerde polymorfe detectie, geamplificeerd fragment lengte polymorfisme (AFLP), DNA microarrays, enz.

Genotyping omvat sequentiebepaling van bepaalde kleine fragmenten van DNA-sequenties en het vinden van verwantheid van de genetische samenstelling met andere individuen die genetische markers gebruiken. Het bepaalt de enkele nucleotide polymorfismen (SNP's) tussen de individuen of de specifieke allelen. Genotypering is van toepassing op een breed scala aan organismen, waaronder mensen. Het is ook van toepassing op micro-organismen zoals virussen, schimmels, enz. En kunnen gebruikt worden om hun genetische varianten te bepalen met de referentieprofielen. In de moleculaire epidemiologie en forensische microbiologie wordt het bestrijden van pathogenen, in het bijzonder micro-organismen, gedaan door de informatie verkregen door genotypering. Genotypering is erg belangrijk in de stamboom analyse. Mensen zijn genotypeerd om moederschap en vaderschap te bevestigen. Genotype zal de dominante en recessieve allelen van genen onthullen die specifieke eigenschappen bepalen.

Figuur_1: RFLP Genotyping

Wat is Sequencing?

Sequencing is het proces van het bepalen van de juiste volgorde van het nucleotide in een gegeven fragment van DNA of RNA. Vrijwel alle informatie die nodig is voor de groei en ontwikkeling van een organisme wordt gecodeerd in het genoom ervan. De beschikbaarheid van technieken om een ​​paar honderd nucleotiden lange nucleïnezuurfragmenten te produceren en te scheiden leidde tot de ontwikkeling van procedures voor het bepalen van de exacte nucleotidesequentie van een gegeven fragment van DNA of RNA.Verschillende soorten sequencingmethoden zijn vandaag beschikbaar. Deze sequentieringsmethoden, samen met de technologieën voor de constructie van genoombibliotheken die het gehele genoom van een organisme vertegenwoordigen, vergemakkelijken de sequentiebepaling van het gehele genoom van dat organisme, die diepgaande analyse van genstructuren, genfuncties, genlocaties, genuitdrukkingen, gen-mapping, genregulerende regio's, enz.

De totale genen van veel virussen, verschillende bacteriën, archaebacteriën, gist en enkele andere organismen zijn in volgorde en in kaart gebracht. Menselijk genoomproject heeft het mogelijk gemaakt om het gehele menselijk genoom te ordenen en in kaart te brengen en zijn eerste ontwerp in 2003 te publiceren. Het is een belangrijke mijlpaal in de vooruitgang van de biologie. Menselijke genoom sequenties worden nu in de medische sector gebruikt om genetische oorzaken te identificeren voor zeldzame ziekten, het risico op het ziektebeeld bij pasgeborenen, het identificeren van genetische details van verschillende kankers, het ontwikkelen van nieuwe therapieën en het ontwikkelen van nieuwe diagnostische hulpmiddelen, enz.

In de plantenwereld, rijstgenoom en Arabidopsis genen zijn getraceerd. Kennis van deze sequenties zal ongetwijfeld ons begrip van hoe cellen en organismen functioneren.

Figuur 2: Een autoradiograaf van sangervolgorde

Wat is het verschil tussen Genotyping en Sequencing?

- diff Artikel Midden voor Tabel ->

Genotyping vs Sequencing
Genotypering is het proces van het bepalen van de genetische samenstelling van een individu en het controleren van de groep of de taxonomie van dat organisme.	Sequencing is het proces om de precieze volgorde van nucleotiden van een bepaald DNA of RNA fragment te bepalen.
Technieken
RFLP, Gene sequencing, PCR, DNA microarrays, AFLP enz.	Sanger sequencing, Gilbert sequencing, Pyrosequencing, Next Generation Sequencing, Shotgun sequencing etc.
Belangrijkste zorgen
Dit is meer bezorgd over de vraag of de genotype verschillen de werkelijke fenotype verschillen geven.	Dit is meer bezorgd over de volgorde van de nucleotiden en zijn verschillen en veranderingen met andere organismen.

Samenvatting - Genotyping vs Sequencing

Genotyping en sequencing zijn nuttig voor het bestuderen van de genetische informatie van organismen. Genotypering is het proces van het bepalen van genotype variaties tussen individuen en het vinden van hun categorieën. Sequencing is het proces van het bepalen van de juiste volgorde van de nucleotiden in het geïnteresseerde fragment of het gebied van DNA. Beide technieken geven belangrijke informatie over de genen en genen.

Referentie:

1. "Genotyping methodes. "Methoden in de moleculaire biologie (Clifton, N.J.). U. S. National Library of Medicine, n. d. Web. 20 februari 2017.

2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin en M. D. Shriver. "Melting Curve Analysis of SNPs (McSNP®): Een Gelvrije en Goedkope Aanpak voor SNP Genotyping. BioTechniques 30. 2 (2001): 358-67. Web.

Image Courtesy:

1. "RFLP genotypering" Door onbekend - National Institutes of Health (Public Domain) via Commons Wikimedia

2."Radioactief Fluorescent" Door Abizar in Engels Wikipedia (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia