Verschil tussen Exome en Transcriptome | Exome vs Transcriptome

Belangrijkste verschil - Exome vs Transcriptome

Een gen bevat coderende en niet-coderende regio's erin. Coderende sequenties staan ​​bekend als exonen, en niet-coderende sequenties staan ​​bekend als introns. De nucleotidesequentie van de exonen van een gen vertegenwoordigt de genetische code van het gen om het specifieke eiwit te synthetiseren. Daarom blijven exonen in het mRNA-molecuul. Het totale exongebied van het genoom staat bekend als exome, en het is een belangrijk onderdeel van het genoom. De genetische code van de genen wordt omgezet in de genetische code van het mRNA-molecuul, dat nodig is voor de productie van eiwitten. De gehele mRNA-moleculen die in een cel of een celpopulatie getranscribeerd zijn, staan ​​bekend als een transcriptoom. Het belangrijkste verschil tussen exome en transcriptome is dat

exome de sequenties van de exonregio's van het genoom vertegenwoordigt, terwijl transcriptome het totale mRNA van een cel of een weefsel op een gegeven moment vertegenwoordigt.

INHOUD

1. Overzicht en sleutelverschil

2. Wat is Exome

3. Wat is Transcriptome

4. Side by Side Vergelijking - Exome vs Transcriptome

5. Samenvatting

Wat is Exome?

Genen bestaan ​​uit exons, introns en regulatorische sequenties. Exonen zijn de genregio's die worden getranscribeerd in mRNA-sequentie tijdens de transcriptie. Introns en andere niet-coderende gebieden worden verwijderd tijdens de transcriptie. De nucleotidesequentie van exonen bepaalt de genetische code van het gen dat het specifieke eiwit dat het codeert, synthetiseert. Alleen exonen blijven binnen mRNA van een eiwit. De verzameling exonen in het genoom staat bekend als exoom van een organisme. Het is een onderdeel van het genoom dat in genen wordt uitgedrukt. Bij mensen vertegenwoordigt exome 1% van het genoom. Het is het eiwit coderende gedeelte van het menselijk genoom.

Figuur 01: Exome

Wat is Transcriptome?

Het transcriptoom is de verzameling van alle proteïne-coderende en niet-coderende transcripten (RNA's) in een bepaald weefsel. Transcriptome vertegenwoordigt de verzameling van totale mRNA moleculen uitgedrukt door de genen in een cel of een weefsel. Het transcriptoom van een cel kan worden gevarieerd met het transcriptoom van een ander celtype. De transcriptoom is ook dynamisch - het verandert met de tijd in reactie op zowel interne als externe stimuli. Zelfs binnen hetzelfde weefsel of binnen hetzelfde celtype kan de transcriptoom na enkele minuten veranderen.

Transcriptoom verschilt van exome van een organisme. Transcriptome omvat alleen de uitgedrukte exome sequenties.Hoewel de exome van een cel hetzelfde blijft, verschilt het transcriptome tussen cellen, omdat genuitdrukking niet hetzelfde is voor alle cellen of weefsels. Alleen essentiële genen worden uitgedrukt in verschillende cellen en weefsels. Gene-expressie is een specifiek proces van weefsel of celtype. Het wordt geregeld door verschillende factoren, waaronder omgevingsfactoren. Daarom kan transcriptoom variëren met externe milieuomstandigheden.

Transcriptome wordt gebruikt als voorloper voor proteomics studies. Alle eiwitten zijn afgeleid van mRNA sequenties. Vertalingswijzigingen kunnen resulteren in de veranderingen in eiwitten. Transcriptome levert echter belangrijke basisinformatie voor de proteomische studies.

Figuur 02: Transcriptoom van embryonale stamcellen

Wat is het verschil tussen Exome en Transcriptome?

- diff Artikel Midden vóór Tabel ->

Exome vs Transcriptome

Exome is de verzameling eiwitcoderende regio van de genen.
Transcriptome is de verzameling van alle getranscribeerde RNA inclusief mRNA.	Monster
Exome wordt bestudeerd met behulp van DNA-monster.
Transcriptoom wordt bestudeerd met behulp van een RNA-monster.	Studiemethode
Geheel exome sequencing is de methode om exome te bestuderen.
RNA sequencing is de methode om transcriptoom te bestuderen.	Samenvatting - Exome vs Transcriptome

Exons zijn de coderende sequenties van de genen en bepalen de mRNA sequenties van de eiwitten. De verzameling van deze coderende sequenties (exonen) staat bekend als exome van een organisme. Genen worden getranscribeerd in mRNA moleculen voorafgaand aan het maken van eiwitten. De totale mRNA-moleculen van een cel of een weefsel op een gegeven moment staan ​​bekend als transcriptoom. Transcriptome vertegenwoordigt de genen die actief worden uitgedrukt in mRNA op een gegeven moment. Transcriptome is cel- en weefselspecifiek en heeft gevolgen voor de milieuomstandigheden. Dit is het verschil tussen exome en transcriptome.

Referenties:

1. Sarah et al., "Targeted Capture en Massively Parallel Sequencing van Twaalf Human Exomes. " Natuur. U. S. National Library of Medicine, 10 september 2009. Web. 01 april 2017

2. Mutz et al. "Transcriptome analyse met behulp van volgende generatie sequencing. "Elsevier: Artikel Locator. N. p., September 2012. Web. 01 april 2017

Image Courtesy:

1. "De transcriptoom van pluripotente cellen" Door Grskovic, M. en Ramalho-Santos, M., De pluripotente transcriptoom (10 oktober 2008), StemBook, ed. De Stem Cell Research Community, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24 1, // www. stembook. org. - [1] DirectStemBook Figuur 2 De transcriptoom van pluripotente cellen. Grskovic, M. en Ramalho-Santos, M., De pluripotente transcriptoom (10 oktober 2008), StemBook, ed. De Stem Cell Research Community, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24. 1, (CC BY 3. 0) via Commons Wikimedia