Verschil tussen gelektroforese en SDS Pagina | Gel Elektroforese vs SDS Pagina

Anonim

Belangrijkste verschil - Gel elektroforese vs SDS Pagina

Gelelektroforese is een techniek die macromoleculen in een elektrisch veld scheidt. Het is een gemeenschappelijke methode in Moleculaire biologie om DNA, RNA en eiwitten van mengsels te scheiden naargelang hun moleculaire afmetingen. SDS Page is een soort gelelektroforese die wordt gebruikt om eiwitten van een eiwitmengsel op basis van hun maten te scheiden. Gelelektroforese is een term die wordt gebruikt om te verwijzen naar de normale techniek die wordt toegepast op DNA, RNA en eiwitscheiding terwijl SDS Page een één soort gelelektroforese is. Dit is het belangrijkste verschil tussen gelelektroforese en SDS Page.

INHOUD

1. Overzicht en sleutelverschil

2. Wat is Gel Electrophoresis

3. Wat is SDS Page

4. Zij aan elkaar vergelijken - Gel elektroforese vs SDS Pagina

5. Samenvatting

Wat is Gel Electrophoresis?

Gelelektroforese is een gebruikelijke techniek die in laboratoria wordt gebruikt om geladen moleculen zoals DNA, RNA, eiwitten, enz. Uit hun mengsels te scheiden. Een gel wordt gebruikt in gelelektroforese. Het fungeert als een moleculaire zeef. Er zijn twee soorten gels gebruikt in gelelektroforese, namelijk agarose en polyacrylamide. Selectie van een gel- en gelpreparatie zijn belangrijke factoren die in gelelektroforese moeten worden overwogen, aangezien de poriegrootte van de gel zorgvuldig gemanipuleerd moet worden voor een goede scheiding van moleculen door gelelektroforese. Gelelektroforese heeft een elektrisch veld verbonden aan twee uiteinden van de gel. Eén einde van de gel toont een positieve lading terwijl het andere uiteinde negatief geladen is.

DNA en RNA zijn negatief geladen moleculen. Zodra ze geladen zijn in de gel van het negatieve uiteinde van de gel en op het elektrische veld worden aangebracht, migreren ze door de gelporieën naar het positief geladen einde van de gel. De snelheid van de migratie hangt af van de lading en de grootte van het molecuul. Kleiner moleculen migreren gemakkelijk door de gel poriën dan grotere moleculen. Vandaar, kleinere moleculen reizen een lange afstand door de gel en de grotere moleculen reizen een korte afstand. Om de reizen van moleculen op de gel te waarnemen, worden speciale soorten kleurstoffen gebruikt. Het elektrische veld wordt gedurende een bepaalde periode toegepast en gestopt om het verlies van moleculen te voorkomen en de moleculen op hun gereden posities te houden. Verschillende bands kunnen in de gel waargenomen worden.Deze bands vertegenwoordigen de moleculen van verschillende maten. Daarom is gelelektroforese nuttig om moleculen te differentiëren volgens hun maten.

Gelelektroforese is opgenomen in verschillende technieken als een voorbereidende techniek in Moleculaire biologie, zoals PCR, RFLP, klonen, DNA sequencing, Southern blotting, genoom mapping, enz.

Figuur 01: Agarose gel elektroforese

Wat is SDS Page?

Natriumdodecylsulfaatpolyacrylamidegelelektroforese (SDS Page) is een soort gelelektroforese gebruikt om eiwitten te scheiden. Wanneer gelelektroforese wordt gebruikt om eiwitten te scheiden, zijn speciale behandelingen nodig omdat eiwitten niet negatief geladen zijn als DNA en RNA en niet migreren naar het positieve einde of negatieve einde. Daarom worden eiwitten gedenatureerd en bedekt met een negatieve lading voorafgaand aan gelelektroforese. Het wordt gedaan met behulp van een detergent genaamd natriumdodecylsulfaat (SDS). De gelelektroforese die SDS en een polyacrylamidegel gebruikt voor het ondersteunende medium is bekend als SDS Page. Deze techniek wordt vaak gebruikt in biochemie, genetica, forensics en moleculaire biologie.

Tijdens SDS Page worden eiwitten gemengd met SDS. SDS ontvouwt eiwitten in een lineaire vorm en bedekt ze met een negatieve lading die evenredig is aan hun moleculaire massa. Door de negatieve lading migreren eiwitmoleculen naar het positieve lading-einde van de gel en scheiden ze volgens hun moleculaire massa's. In SDS Page wordt polyacrylamide gebruikt als de vaste drager voor de gel. De feitelijke scheiding van de eiwitten hangt hoofdzakelijk af van de eigenschappen van de gel. Vandaar dat het polyacrylamide gelpreparaat zorgvuldig moet worden uitgevoerd en de juiste concentraties polyacrylamide moeten worden gebruikt. Polyacrylamide gels tonen hoge resolutie dan agarosegels. Daarom wordt SDS Page beschouwd als een hoge resolutie techniek voor eiwitscheiding.

SDS Page is een soort denaturerende gelelektroforese. Het heeft een belangrijke beperking in eiwitanalyse. Aangezien SDS eiwitten voorafgaand aan scheiding denkt, laat het de detectie van enzymatische activiteit, eiwitbindende interacties, eiwitcofactoren, enz. Niet toe.

Figuur 02: SDS pagina

Wat is het verschil tussen gelelektroforese en SDS Page?

- diff Artikel Midden vóór Tabel ->

Gel elektroforese vs SDS Pagina

Gelelektroforese is een methode die wordt uitgevoerd om macromoleculen te scheiden met behulp van een elektrisch veld. SDS Page is een gel electroforese techniek met hoge resolutie die gebruikt wordt om eiwitten op basis van hun massa te scheiden.
Gel Run
Het kan op horizontale of verticale wijze worden uitgevoerd. SDS-pagina loopt altijd verticaal.
Basis voor scheiding
De scheiding vindt plaats volgens de lading en de grootte. Proteinscheiding vindt plaats volgens de massa en de lading.
Resolutie
Agarosegelelektroforese heeft een lage resolutie en polyacrylamidegelelektroforese heeft een hogere resolutie SDS Pagina heeft een betere resolutie.
Denaturatie
Gelelektroforese omvat zowel denaturerende als niet-denaturerende technieken. SDS Page denatureren eiwitten voorafgaand aan de scheiding.

Samenvatting - Gel elektroforese vs SDS Pagina

Gelelektroforese is een gebruikelijke techniek die wordt gebruikt voor de scheiding en analyse van DNA, RNA en eiwitten op basis van hun grootte en lading. Er zijn twee hoofdtypen gelelektroforese, namelijk agarosegel-elektroforese en polyacrylamidegel-elektroforese. Agarose gels worden voornamelijk gebruikt voor nucleïnezuur scheiding; wanneer hogere resolutie nodig is, worden polyacrylamide gels gebruikt. SDS Page is een soort gelelektroforese die vaak gebruikt wordt om complexe mengsels van eiwitten te scheiden. Het wordt beschouwd als een hoge-resolutie eiwit scheidingstechniek. Dit is het verschil tussen gelelektroforese en SDS Page.

Referenties:

1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig, en David H. Petering. "Inheemse SDS-PAGE: Hoge resolutie elektroforetische scheiding van eiwitten met behoud van natuurlijke eigenschappen, inclusief gebonden metaalionen. www. NCBI. NLM. nih. gov. N. p., Mei 2014. Web. 7 april 2017

2. Stellwagen, Nancy C. "Elektroforese van DNA in agarose gels, polyacrylamide gels en in vrije oplossing. "Elektroforese. U. S. National Library of Medicine, juni 2009. Web. 07 april 2017

Image Courtesy:

1. Gelelektroforeseapparatuur (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia

2. "DNA Agarose gelelektroforese" Door School of Natural Resources van Ann Arbor - DNA lab (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia